本报讯 近日,四川大学华西医院生物医学大数据中心俞鹏研究员以共同作者身份在国际知名期刊《Advanced Science》(《尖端科学》)发表了名为《Protein Arginine Methyltransferase PRMT5 Regulates Fatty Acid Metabolism and Lipid Droplet Biogenesis in White Adipose Tissues》的文章。在该文章中,作者以计算生物学为指导,运用多种实验手段详细阐释了蛋白精氨酸甲基转移酶5 (PRMT5)在脂肪细胞及全身新陈代谢过程中的作用;同时,文章研究结果也为PRMT5参与到冷刺激产热过程提供了依据,意义重大。
此前,俞鹏研究员课题组在杂志《Scientific Data》(《科学数据》)发表了题为《Integrated analysis of a compendium of RNA-Seq datasets for splicing factors》的封面文章,文章计算结果预测PRMT5是潜在调控脂肪组织的重要因子,且其调控的基因在脂肪组织冷刺激诱导产热过程至关重要。在此次发表的文章中成功证明在PRMT5脂肪条件性敲除小鼠(Prmt5AKO)中PRMT5的缺失会破坏脂肪酸代谢,并损害白色脂肪细胞中的脂滴生物形成;而L. Dollet等人在2016年的研究表明白色脂肪缺失会严重影响棕色脂肪冷刺激诱导产热功能,因此可以得出,PRMT5与冷刺激诱导产热存在直接关系。
在此次发表的文章中,俞鹏研究员应用gene expression分析和pathway分析等方法,结合CITGeneDB数据库,对多组学数据进行深度挖掘,预测出PRMT5可以通过调节转录延伸因子SPT5调控Bscl2(编码人源脂质合成关键蛋白Seipin)的表达,从而影响脂滴生物形成。按照计算预测,Shihuan Kuang教授课题组通过实验成功证明PRMT5可以甲基化转录因子SPT5使之从Bscl2的启动子上释放,终止Bscl2转录、翻译过程。加之L. Dollet等人发现Bscl2参与小鼠冷刺激诱导产热调控,本工作解释了PRMT5可调控冷刺激诱导产热的机制。此文章在《Advanced Science》的成功发表充分证明,计算生物学可以作为生物学研究先导,为生物学研究指明研究方向,达到事半功倍的效果。(苏泽灏)